вентилятором используют частоты 30-100Hz. На высоких частотах ШИМ электроника вентилятора (в первую очередь, микросхема датчика Холла) может и не работать. Всё зависит от конкретного вентилятора. Вопрос рассматривается в AN-771, AN-772 от Microchip. Много интересного можно почерпнуть и из datasheet на ADM1030. При низкой частоте ШИМ появляется дополнительный шум на этой частоте. К тому же, если есть выход таходатчика, то его сигнал будет искажен. Для кулеров крупных размеров вообще не рекомендуют ШИМ. Я делал многоканальный регулятор для кулеров, и чтобы обойти эти проблемы, фильтровал высокочастотный ШИМ. Дополнительный дроссель на гантельке, диод Шоттки и конденсатор - не большая проблема.