простейшая эквивалентная схема вторички трансформатора тока - эти R и L последовательно, сигнал - источник тока - им паралельно. Добавлять в простейшей модели к этому R пересчитанное из первички активное сопротивление вроде как смысла не имеет - источник тока в первичке с бОльшим сопротивлением.
Паразитную ёмкость такой огромной обмотки и потери в магнитопроводе со счетов сбрасывать не стоило бы, но и учесть их не просто. Эквивалентная схема вторички станет резонансным контуром. Заморачиваться стал бы лишь для широкополосного сигнала.
Как уже писал Леонид Иванович - для одной частоты (узкой полосы частот) всё будет относительно просто. Получившееся расхождения с расчётом можно будет "после сборки доработать напильником".

Если Вы новый оркад используете - обратите внимение на генератор моделей трансформаторов (Magneticdesigner.exe). Задаёте близкий по параметрам сердечник, число витков - он выдаёт готовую модель. Она должна бы получиться ближе к жизни, чем просто R+L.