По PCIe не знаю, но когда делал PCI на базе корки от ПЛДА, то там
был модуль для тестирования, для которого писался файлик с
последовательностью операций на шине (инициализации, записи/ чтения).
Т.е. не совсем то что вы хотите, но позволяло оттестировать проект.
Хотя это давно было, мож чего и поменялось сейчас.