Я сталкивался с тем, что если эта опция не включена, в исполняемый файл не кладутся использованные библиотеки, и их (некоторые файлы, для той проги, что я видел это были: bcbsmp60.bpl, rtl60.bpl, vcl60.bpl, vclx60.bpl) надо, например, класть в папку с исполняемым файлом. Если опция включена, то как я понимаю, они укладываются в ехе файл программы.