Спасибо, это все понятно. Вопрос был в другом-есть ли у кого-нибудь опыт именно при работе с джиттером. Может, я не точно выразился... Программа в порядке-это прерывание как раз и убирает джиттер для основного управляющего сигнала. Но создала его в другом месте, в теле основного цикла измерений :-) А впихнуть фильтр в прерывание невозможно...