RS-232 он двунаправленный, с раздельными линиями приема и передачи. Никто не мешает параллельно с непрерывной передачей МК передавать какой-то запрос/команду от PC в МК для смены характера передаваемой МК информации. Только все-таки лучше любую передачу в пакеты оформлять, с началом и концом. Т.е. любой простенький протокол для связи использовать. Посмотрите, например, WAKE.