А в схеме не может быть косяка ? проверяли ?
И сам марвелл правильно сконфигурировали (config выводами)?
У меня всё замечательно работает, правда с прототипа с марвелом в TQFP першёл на марвел в BGA, и тот, зараза, как только переключается на линк 1000, сразу грется градусов до 80 начинает (не зависимо от того передаётся что то или нет).