Устройство питается от батареек, поэтому постоянная модуляция ИК сигнала частотой не подходит - средний потребляемый ток будет большой. У меня сейчас схема работает вот как: МК ATMega88 просыпается 5 раз в секунду выполняет небольшу процедурку проверки приближения объекта. Т.е. после просыпания проверяет на компараторе 0, затем включает ИК светодиод, проверяет что появилась 1, потом опять выключает и проверяет на 0. Если все три условия выполнились, то переходит к процедуре обработки объекта. Если хотя бы одно условие не выполнилось, то засыпает до следующей проверки. За счет этого средний потребляемый ток удалось снизить до 20 мкА.
Конечно, ваш подход с модуляцией более надежен, но тогда потребляемый ток значительно вырастет - ведь для контура нужно больше времени чтобы "раскачаться" и обнаружить модулированный сигнал.