На нижней стороне припой не расплавляется. Есть три хитрости:
1) температура оплавления паяльной пасты ниже, чем температура расплавления уже оплавленного припоя
2) печь с возможностью отдельной регулировки температуры для верхней и нижней сторон платы в зоне оплавления. Разница - градусов 10
3) массивные компоненты рекомендуется ставить на ту сторону которая паяется последней

Двухсторонний монтаж проблем не вызывает, просто платить за пайку приходится больше, так как производство рассматривает двухстороннюю пайку как две односторонних.