Опыта с фрга только MAX7000, да и те не совсем фпга, с ARMами тоже не работал, пока хватало PIC, MSP430 в тяжелых случаях dsPIC.

Проблема в необходимости обработки сложной математики в реал-тайме с большим объемом выборок при скорости 10...100MSPS.
Пока разбираюсь с МАТЛАБом, дабы уточнить задачу, но похоже без фпга никак, хотя очень хотелось бы уложиться в TMS320F28334 :).
Вопросы

1. Для экскалибуров корпуса только BGA, при потребностях 20...50 устройств в год стоит ли заморачиваться и во сколько примерно может обойтись монтаж, особенно если предварительно понадобится пара опытных образцов :(. С другой стороны себестоимость в пределах 1,5k$ за устройство приемлема (без учета затрат на разработку, это отдельная статья).

3. габариты очень важны, с этой стороны BGA практически идеальный вариант.

4. может будет проще поставить Стратикс2 и внешний МК попроще, тем более что потребление тоже будет играть роль, устройство автономное, полная вычислительная мощность нужна будет сравнительно редко - 2...3 мин раз в 5...30 минут