В даташите дан пример записи. 
Устанавливаются Z,R0,R1.
Видно по циклу, что во время работы SPM меняются Z,R0,R1. 
............
Wrloop:
   ld r0, Y+   ;!!!
   ld r1, Y+   ;!!!
   ldi spmcsrval, (1 << SPMEN)
   call Do_spm           ; вызов
   adiw ZH:ZL, 2         ; SPM ЕЩЕ РАБОТАЕТ!!!
   sbiw loophi:looplo, 2 ;use subi for PAGESIZEB<=256
   brne Wrloop
............................
Do_spm:
; check for previous SPM complete
Wait_spm:
lds temp1, SPMCSR
sbrc temp1, SPMEN
rjmp Wait_spm
; input: spmcsrval determines SPM action
; disable interrupts if enabled, store status
in temp2, SREG
cli
; check that no EEPROM write access is present
Wait_ee:
sbic EECR, EEWE
rjmp Wait_ee
; SPM timed sequence
sts SPMCSR, spmcsrval
spm
; restore SREG (to enable interrupts if originally enabled)
out SREG, temp2
ret