IMHO проще переинициализировать каждые несколько часов, чем потом мучится. Наш 3х-летний опыт говорит:
1) Рекомендуемая частота опроса не выше 16,67Гц на канал (точность внутреннего генератора 6%).
При двух каналах надо делить на 2 и на 3, в результате
примерно 2,5 Гц общий цикл опроса.
2) Нужен либо простейший фильтр для подавления выбросов и (или) процедура повтроного считывания значения. Т.к. периодически возникает непонятная ситуация в потоке показаний, например:
100, 101, 100, 101, 102, 101, -23145687 (ХЗ откуда взялось), 102, 101...