1. Ногу, ессно, настраиваем на выход 2. настраиваем прерывание таймера на "опустить в ноль" и взводим битик "force compare" 3. в прерываниях ставим "поднять в плюс" и ждем срабатывания компаратора.
А еще можно использовать два прерывания. По одному взводить, по другому сбрасывать. Когда на точность и джиттер наплевать - вполне проходит.