Хочу поделить тактовую меги, делаю следующее:

TCCR3B = 0x00; //stop
TCNT3H = 0x00;
TCNT3L = 0x00;

OCR3AH = 0x00;
OCR3AL = 0x03;

OCR3BH = 0x00;
OCR3BL = 0x03;

TCCR3A = 1<<COM3B0;
TCCR3B = 1<<WGM32 | 1<<CS30;//CTC mode

В AVRStudio работает, но как-то подозительно PORTE не изменяет значение, меняться только PINE.

В приступе паранои попробовал, с большим значением прескалера такую строчку if (PINE&0x10) PORTE |= 0x20; else PORTE &= ~0x20; - результат тот же в эмуляторе работает, в железе нифига.