Как повезет, с таким уровнем понимая предмета. И сильно зависит от того, какой именно будет шум. Если сигнал будет сильно зашумлен - то подсчет количества переходов - эо не лучший метод. Если слабо - работать будет. Только фильтровать что-то при максимальной частоте 2 кГц и частоте оцифровки 6 кГц вряд-ли получится: это период сигнала - три точки. Да и с точостью 0.1 Гц при частоте сегнала 2000 Гц не все будет гладко: такую точность невозможно получить считая только переходы через нуль, если частота сигнала 2000 кГц и измеряется 6000 точек в течение секунды.