Не пойму никак... После полного стирания атмела, EEPROM устанавливается в FF или нет?
В ДШ на 1287, в частности, написано:

The EEPROM array is programmed one byte at a time by supplying the address and data together with the appropriate Write instruction. An EEPROM memory location is first automatically erased before new data is written. If polling is not used, the user must wait at least tWD_EEPROM before issuing the next byte. (See Table 29-15.) In a chip erased device, no 0xFFs in the data file(s) need to be programmed.

Проверил STK. Сделал полную очистку - из епрома читаются предыдущие значения...

Я программатор свой оптимизирую. Хочу ускорить программирование путём не записи областей флеша и епрома в исходном хекс файле, заполненных FF. Для флеша сделал, его страничный буфер после записи страницы гарантировано в FF становится. А вот с епромом непонятки...