Конечно, имеет смысл усыплять абсолютно все, что не используется в режиме сна и оставить включенными только те цепи, которые нужны для включения дивайса (+)
Идея с блокировкой кнопки проснувшимся МК вполне рабочая, я сам так делал. Да, при питания от литиевых аккумуляторов обязательно используйте схему защиты, а лучше сразу выберите аккумуляторы со встроенной дащитой ...