1 У вас в задании написано 6 битное число секунд, но вы кругом аналируете 7 бит, например вы выходите из начального цикла анализируя на неравенство нулю 7 бит каждого байта, хотя надо анализировать только по 6 младших бит.
2 Кто вам сказал что 2 старшие считанные бита равны 0? А если они не равны 0 то почему вы считаете что CL(DL)=0 будет условем выхода из цикла? CL(DL) может быть равно 0, 40h,80h, 0C0h в момент выхода из цикла. Хотите чтоб было так как указано вами - смените команду
TEST AX,0111111101111111B; на AND AX,0011111100111111B и обнулите ненужные биты.
3 Коментарий "отработали секунду активатором" и "отработала секунду центрифуга" неверен секунда в тот момент не прошла.
4 Вы включаете центрифугу и пр... но где вы ж их выключаете? Просто остановить секундомер недостаточно.