На плате в слое board (или в другом выбранном Вами или созданном для этого) формируем полигон по размеру чуть более печатной платы - так лучше видны границы платы при печати негатива).Этот слой и будет Background.
Далее File Print->SetupPrintJob->LayrPrintOrder выбираем такую последовтельность печати слоев чтобы слой, выполняющий роль Background, печаталься первым - в моем случае board, а затем уж сигнальный слой.
Ну и все! А то уж я поразился - такой инструмент, и нет возможности напечатать негатив!