В теории:

1 Можно задать ширину трасс или волновое сопротивление.
2 Длину трасс, количество переходов можно ограничить.
3 Задать несколько проходов оптимизатора для согласования длин.
4 Задать скоростные параметры связей - скорость нарастания выбросы сигнала в +/-
5 Назначить периодичность типов разводки(фанауты, минимизация виа, просто разводка и тд) и цепи/классы для разводки

6 Загрузить реальные данные в HyperLinx и посмотреть что же получилось - говорят соответствует практике.

Пункты 1..3 и 5 делал сам.
Сильно успешной назвать автоматическую разводку не могу.
После двух проходов оптимизации явно видны возможности для ручной правки слишком длинных проводников.

Может сказывается большой опыт по разводке и маленький опыт по работе с Expedition PCB? ;-)