очевидно что по карте памяти 0х400000 - это байтовый адрес , а 0х200000 это в двухбайтных словах, адресация памяти данных у процессора - в словах
а по поводу странностей - вооружитесь осциллографом и таблицей Signal Descriptions из мануала и просмотрите все сигналы на всех ногах, где-то что-то стопорит ваш процессор (выбор тактирования или ardy на emif или hpi или еще что-то)
не находил я никаких странностей у этого процессора, все работает как написано