было актуально в то время, когда многие программы пестрели магическими цифрами вроде mov r1,#0ECH или mov P3,#02BH. Тогда было легко напороться, что соседняя функция (возможно, написанная кем-то) попортила не свой бит. Но штиль - это привычка, и Ваша "паранойя" - не самая плохая привычка. Думаю, для XMega это останется, только придется изменить детали - short-инициализацию неизменных "портовых" ресурсов проводить в начале главного цикла, возможно, в начале функций, активно использующих биты порта, и перед сном. А перед считыванием каждого бита - бита - опционально, необязательно. Я по крайней мере, буду стараться придерживаться такого.