на выводе "ОС2B" частота выше в два раза, чем на "ОС0B" и "ОС0A" :(
На "ОС2A" совсем нет ШИМ, уж не знаю с чем это связано, возможно с тем что этот вывод (PB3) имеет альтернативную функцию "MOSI"?

void Timer0_Init(void) {
    TCCR0A |= (1<<COM0B0)|(1<<COM0B1)|(1<<COM0A0)|(1<<COM0A1)|(1<<WGM01)|(1<<WGM00);    /*Инициализация таймера "0" в режим Fast PWM (non-inverting)*/
    TCCR0B &= (1<<WGM02);
    
    TCCR0B |= (1<<CS02);
    TCCR2B &= ~((1<<CS00)|(1<<CS01)); 
    
    TCNT0 = 0x00;		
    OCR0A = 0x20;
    OCR0B = 0x20;
}

void Timer2_Init(void) {
    TCCR2A |= (1<<COM2B0)|(1<<COM2B1)|(1<<COM2A0)|(1<<COM2A1)|(1<<WGM21)|(1<<WGM20);    /*Инициализация таймера "2" в режим Fast PWM (non-inverting)*/
    TCCR2B &= (1<<WGM22);

    TCCR2B |= (1<<CS22);
    TCCR2B &= ~((1<<CS20)|(1<<CS21));

    TCNT2 = 0x00;		
    OCR2A = 0x20;
    OCR2B = 0x20;
}

Посмотрите свим всевидящим оком, шо за нах?

Еще я подметил что на 157й страничке даташита "ATmega48/88/168" ошибки в таблице 17-8 "Waveform Generation Mode Bit Description". Там, в шапке, биты странно названы, не так как в том месте где указывается их расположение в байте конфигурации. Ну или я что-то не так понял.