TCCR0 = (1<<CS02)|(0<<CS01) |(1<<CS00); //prescaler for counter 0 TCCR1B= (0<<CS02)|(0<<CS01) |(1<<CS00)|(1<<WGM12); //CTC mode, no prescaled
TIMSK = (1<<TOIE1)|(1<<TOIE0)|(1<<OCIE1A); //for counter 0 and counter 1
OCR1AL= 143; //init OCR1AL for CTC mode
OCR1AH= 0;

т.е. в обработчике прерываний

#pragma vector = TIMER1_OVF1_vect
__interrupt void overflow_timer1(void)
{
CntMC++;
}

у меня переменная будет каждый раз инкрементированться при достижении значения 143 у счетчика. т.е. 143 тика кварца