Консольный бутлоадер. Ничего лишнего. Имеется графическая оболочка, но она вызввает консоль.
Бутлоадер прозрачен, т.е. по сбросу запускается основная программа с адреса 0.
Бутлоадер запускается тогда, когда сначала запускается консоль. Консоль начинает
ждать в указаном COM порте ответ от бутлоадера. Запустив консоль, нужно сбросить контроллер.
Тогда консоль свяжется с бутлоадером и начнется программирование.

Если нужна перекомпиляция:
1. Открываем проект а AVRStudio
2. В файле BOOTLOAD.ASM правим строки:

	.equ    STX_PORT        = PORTD |
	.equ    STX_DDR         = DDRD	| - для TXD прописываем порт и номер пина
	.equ    STX             = PD1	|



	.equ    SRX_PIN         = PIND	|
	.equ    SRX_PORT        = PORTD	| - для RXD прописываем порт и номер пина
	.equ    SRX             = PD0	|

3. Компилируем. Шьем полученый HEX, устанавливая фьюзы в 0 bootrst, bootsz0, bootsz1.

Если перекомпиляция не нужна, то берем в директории HostSide нужный hex - файл и шьем его, устанавливая фьюзы в 0 bootrst, bootsz0, bootsz1.

Далее в директории PCSide запускаем батник FBOOT.BAT с текстом:

fboot17.exe -b38400 -c2 -pLCD_INT.hex -vLCD_INT.hex

где 

-b38400 - битрейт

-c2 	- номер сом - порта

-pLCD_INT.hex - файл для программирования

-vLCD_INT.hex - файл для проверки

Запускается программа fboot17.exe. Далее надо нажать RESET контроллера.

Отчет выглядит так:

D:\8051\AVR\bootloader\PCSide\fboot17.exe -b57600 -c2 -pLCD_INT.hex -vLCD_INT.hex
COM 2 at 38400 Baud: Connected
Bootloader V2.1
Target: 1E9702 ATmega128L
Buffer: 1024 Byte
Size available: 130048 Byte
Program LCD_INT.hex: 00000 - 02271 successful
Verify LCD_INT.hex: 00000 - 02271 successful
CRC: o.k.
Elapsed time: 5.71 seconds

Если контроллер не опознан (Target: 1E9702 ATmega128L, хотя это и не обязательно), то ручками правим файл FBOOT17.DEF:

прописываем сигнатуру в виде:

1e9702 : ATmega128L

Сигнатура выводится программой в любом случае.

http://www.societyofrobots.com/bootloader_50_robot.shtml