О каких интервалах времени для обоих таймеров идет речь?
Таймер1 тактируется не от системного тактового сигнала, а от внешнего(Приходящие импульсы, число которых нужно зарегистрировать).При этом его счетный регистр увеличивается на 1 при каждом поступающем импульсе.А таймер2 формирует временной интервал по прерыванию 1 раз в сек. и тактируется от часового кварца, в подпрограмме обработке которого и считывается счетный регистр таймера1 в котором записано число импульсов пришедших за одну сек.!