По моим воспоминаниям, давно это было. Если две fs в каждую монтируеш свой девас в твоём случае две карточки то всё должно работать. Может у тя процедуры записи чтения на диск не реентерабельны ??? У тебя паралелизм в проге есть ?? типа чтение или запись диска из прерывания вызваться может ?