Конденсатор на входе АЦП выбирается из соображений, чтобы RC-цепочка не сильно портила АЧХ в рабочей полосе частот. Частота среза цепочки должна быть порядка частоты дискретизации.

Буфер опоры у Вас инвертирующий, что неправильно.
Регулировка нуля тоже сделана неправильно. Я никогда не применял AD9283 (применял AD9280, но там всё по-другому), поэтому сходу не скажу насчет допустимого синфазного напряжения на входах. Но, скорее всего, инверсный AIN нужно будет посадить на опору, а буфер со сдвигателем уровня сделать таким, чтобы он обеспечивал на входе АЦП при регулировке сдвига VREF плюс-минус половина полной шкалы АЦП. Это должен быть неинвертирующий усилитель с K > 1, на вход которого с движка потенциометра подается VREF, в земле потенциометра резистор для ограничения сдвига в минус. Все резисторы нужно посчитать.