Не стоит заморачиваться этим. когда фат32 появисля, видел тесты, которые говорили, что фат 32 хоть иногда и уступает по скорости фат 16, то это доли процента. а доступ к свопу вообще от фс слабо зависит, т.к это один файл и скорее всего непрерывный.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)