Можно просто читать из регистра PINx даже если это выход. Другое дело, что мало кто сможет перебить потенциал, выдаваемый АВРом - скорее всего, просто сожжёшь эту ножку порта. Эквивалентная схема АВРовской "1" - это подтяжка 25 Ом к +5в. К нулю - тоже 25 Ом.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)