Можно прекрасно исп. вложенные прерывания, хотя бы как раз для того, что если произошло прерывание с более низким приоритетом, во время его обработки не исключать возможность прерывания с более высоким
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)