Из вкладки File Print заходим в Colors и устанавливаем в сигнальном слое,который печатаем (например в Bottom), все в белое. Далее выбираем слой (или специально создаем для этого) на котором ничего нет - я выбрал слой board, и устанавливаем на нем Poly в ченое -этот слой будет служить подложкой т.е. выполнять роль Background . Истинный Background тоже устанавливаем в черное. Иначе дырочки в падах могут не пропечататсья.